健康保険では、被保険者が受ける様々な報酬（給料、諸手当など）の月額を、一定の幅で区分した標準報酬にあてはめて事務処理をしています。これまでは、この標準報酬をもとに保険料の額が計算されていましたが、平成15年4月からは、保険料の計算方法に「総報酬制」が導入されました。このため、賞与等(標準賞与額）に対しても月々の給料と同率の保険料率をかけて保険料が計算されます。

保険料は「基本保険料」と「特定保険料」に分かれています。
「基本保険料」とは、加入者への医療給付、健康づくりを支援する保健事業などにあてる保険料。「特定保険料」とは、高齢者への支援金や給付金などにあてるための保険料です。
このほか、介護保険料についても、健康保険の保険料を合算して保険組合が徴収します。